关于跨年度成本费用，虽然现在的企业所得税法与会计准则均遵循权责发生制，按道理来讲似乎不应发生不一致的情况，但现实征管中，由于我国实行“以票控税”的征管系统，以及会计年度与汇算清缴年度的不同，经常会出现财税处理的差异。
大多数企业的做法是将跨年度成本费用作纳税调整，这也是之前延续习惯所致。实际上，在《》（，以下简称34号公告）以及《》（，以下简称15号公告）下发后，对于跨年度成本费用的处理，还是需要分情况的。
第一种情况：当年成本费用已经发生，企业也已作账务处理，但税前扣除凭据不能在当年取得。
比如存货暂估入账、固定资产暂估入账等。有的企业年底购入原材料，已经领用生产，但由于结算等问题，一直未取得发票，为准确核算成本，在年底按照合同等资料暂估计入存货与成本。财务核算按照权责发生制进行账务处理。而在税务处理上，对无发票的购进货物是否能在税前扣除则比较敏感。
34号公告规定，企业当年度实际发生的相关成本、费用，由于各种原因未能及时取得该成本、费用的有效凭证，企业在预缴季度所得税时，可暂按账面发生金额进行核算；但在汇算清缴时，应补充提供该成本、费用的有效凭证。即在汇算清缴前取得有效凭证，证明该成本费用的真实性，可不需纳税调整。
对于此问题，有的企业在认识上有一定的误区，认为所谓的“在汇算清缴时，应补充提供该成本、费用的有效凭证”中的有效凭证，指的是发票日期是去年的有效凭证，比如2012年底的暂估存货，发票必须是2012年开具的，只是取得时间在2013年。这种认识显然是错误的，如企业在2013年4月30 日汇算清缴，取得发票日期为2013年4月30日前的发票，即可税前扣除。
在实际工作中，还有一种利用暂估入账进行税负转移的现象。比如，有的企业年底将暂估存货的价值人为加大并结转成本，待来年时，按照较小的发票的金额确认存货价值。这样就将当年的应纳所得税额转移到了来年。对此情况，税法并无明确的规定，但根据实际经验来讲，对于跨年度差额较大且无正当理由的存货暂估，税务机关有理由保持职业怀疑。
第二种情况：当年成本费用已经发生，但未在当年税前扣除，在以后年度发现。
比如核算错误的销售成本在以后年度发现、当年的资产损失未履行税务机关报批制度，未在税前扣除，以后年度经税务机关审批可税
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